Neziskové organizace mohou působit v celé řadě odvětví, od zdravotnictví přes školství, péči o děti a mládež, sociálně vyloučené skupiny obyvatel až po seniory nebo drogově závislé. Požadavky na vývoj aplikace nebo softwaru tak mohou být velmi různé. Jedním z nejrozšířenějších typů jsou charitativní a fundraisingové aplikace, které pomáhají vybírat finanční prostředky na obecně prospěšné účely. Stejně jako ve většině odvětví se i v neziskovém sektoru velmi dobře uplatní systémy CRM a ERP, a to zejména u větších organizací, jejichž fungování vyžaduje efektivní řízení vlastních zaměstnanců a komunikaci se zákazníky. Důležité jsou ale i marketingové aplikace, které neziskovám pomáhají šířit informace o jejich projektech a budují povědomí o dané problematice.